La creación del Herbario está ligada a un movimiento de investigación e interés por la flora que brota en un lugar por la botánica del Chocó que comienza a ser valorada y que estimuló un buen número de estudios florísticos, etnobotánicos y ecológicos . Pero, sin duda alguna el hecho más importante fue cuando en 1980 la Universidad Tecnológica del Chocó "Diego Luis Córdoba" mediante acuerdo No. 019 del Consejo Superior aprueba e institucionaliza el Programa de Estudio Integral de la Flora del Departamento del Chocó y crea el Herbario Regional del Chocó como único centro en el departamento con las condiciones básicas para apoyar las inquietudes de dicha índole en el educando y los profesionales que lo requieren, está comprometido con el fortalecimiento académico-investigativo de la Universidad y el departamento.
A partir de ese gran acontecimiento se suman otras investigaciones de gran importancia que han permitido además del incremento en el número de ejemplares del herbario, la definición de estrategias para su continuidad, acorde al concierto de la investigación botánica nacional e internacional. éntre estas están las de C. La Rotta en 1985, quien adelantó el estudio etnobotánico de las comunidades Emberá del Alto Río Baudó, reportando 200 especies; F. García y W. Córdoba en 1985, identificaron 320 especies para el área urbana de Quibdó; J. Echavarria y F. García en 1987, realizan el estudio sociocultural de la medicina popular del Alto Atrato; J. A. Gómez realizó el estudio etnobotánico de las comunidades Emberá del Alto 21 en Quibdó, donde identificó 40 especies medicinales; para 1988, se ejecuta en el marco de dicho programa, una avanzada hacia la región de la Ensenada de Utría, dando muy buenos resultados, entre ellos, J. Espina y F. García reportaron 520 especies; M. Medina y L. Lemos realizan la Identificación de metabolitos secundarios en plantas medicinales de la Ensenada de Utría, detectando 43 especies; D. Londoño y R. Escobar, adelantaron la clasificación ecológica preliminar de los tipos de bosque en la Ensenada, reconociendo cuatro zonas de vida (bmh-T, bp-T, bp-T/transición fría y bp-PM), igualmente reportaron la existencia de 27 unidades de suelos en la zona de estudio.
El Herbario "CHOCO" ha desarrollado diversas actividades, producto de su vinculación e interrelación con otros estamentos del orden Nacional e Internacional. Vale mencionar en sus anales la VI y la XIX reunión de la Asociación Colombiana de Herbarios, coloquio sobre Medicina Tradicional (Etnobótanica) y Cursos, entre otros eventos. Incremento de sus colecciones con la ejecución de sus programas Flora del Chocó y la asesoría a estudiantes de tesis de la Universidad Tecnológica del Chocó, Nacional de Colombia, Valle, Antioquia, Distrital, entre otras nacionales y extranjeras. Su personal ha sido activo en la programación que ha adelantado hasta el momento la ACH.
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